Ngày 7 tháng 10 năm 1998, Phoebe trở về từ New York sau sáu tháng, khi trải qua cái chết của bà. Vào đêm đó, trong khi chơi bói toán với Piper, con trỏ di chuyển đột ngột trên Tấm Bảng Gia Truyền, đánh vần ra chữ "gác mái" , cô đi lên gác mái, nơi cô tìm thấy Book of Shadows. Phoebe sau đó đọc câu thần chú Dominus Trinus, điều đó đã đánh thức sức mạnh của ba chị em mà trước đó đã bị ràng buộc bởi bà của họ khi họ còn nhỏ. Ngày hôm sau, cô nhận được linh cảm đầu tiên của cô: hai thiếu niên bị tông bởi một chiếc xe. Cả Prue và Piper đều không tin Phoebe nói rằng họ là phù thủy, nhưng cả hai đã buộc phải thừa nhận nó là sự thật khi họ từng thể hiện sức mạnh của chính mình. Sau đó, cả ba chị em cùng nhau khai thác sức mạnh của Bộ Ba và tiêu diệt Jeremy - là con quỷ và cũng là bạn trai của Piper. Và sau đó Phoebe bắt đầu cuộc sống của một phù thủy.

Không giống như Prue và Piper khi biết mình là phù thủy, Phoebe chấp nhận nó và luôn hứng thú với phép thuật. Tuy nhiên, Phoebe thường xuyên sử dụng ma thuật như một công cụ, cô thường phá vỡ các quy tắc cơ bản nhất của một phù thủy tốt: Có phép thuật không có nghĩa là để sử dụng cho mục đích cá nhân. Dẫn đến việc sau này bị tước đi sức mạnh của mình, nhưng cô đã rút ra được bài học riêng cho mình và khôi phục được sức mạnh, sau này cô đã sử dụng phép thuật cẩn thận hơn và không lạm dụng chúng.

Tại tang lễ của chị gái mình - Prue, cô đã gặp một phụ nữ tên là Paige Matthews, và khi họ bắt tay, cô đã có một linh cảm rằng Paige sẽ bị giết bởi Shax, con quỷ đã giết Prue. Piper quá đau buồn để giúp đỡ, cô quyết định đi với Cole để họ có thể cứu Paige. Với điều tra của Cole, họ phát hiện ra rằng cô ấy là người có thể tái tạo lại sức mạnh của Bộ Ba. Sau đó, họ phát hiện ra rằng Paige là em gái cùng mẹ khác cha với họ. Paige sau đó đến nhà và bắt tay với chị em một nửa của mình, sức mạnh của Bộ Ba Phép Thuật (The Charmed Ones) đã được tái tạo.